¿Qué es el ADN ambiental?

El ADN ambiental (eDNA por su acrónimo en inglés) corresponde al material genético que ha sido liberado por un organismo en el ambiente por medio de procesos de excreción, reproducción, desprendimiento de piel, secreciones mucosas, saliva, entre otros. Este material genético puede ser colectado y aislado desde muestras de agua, sedimento, suelo, e incluso aire, y con el cual es posible diagnosticar la biodiversidad de un determinado lugar, aún cuando los organismos se encuentran en bajas densidades.

Existen dos enfoques con los cuales podemos analizar el ADN ambiental: a través de la identificación de organismos de sólo una especie (enfoque uniespecífico o barcoding), y a través de la detección de organismos de muchas especies (enfoque multiespecífico o metabarcoding).

Enfoque uniespecífico: basado en técnicas que utilizan marcadores moleculares específicos por especie (barcoding), lo que permite identificar de forma específica un organismo desde una muestra ambiental, ya sea agua, sedimento, suelo, nieve, aire, o alguna materia prima obtenida desde cualquier muestra ambiental.

Aplicaciones

  • Identificación para la gestión y protección de especies nativas, endémicas, amenazadas o en peligro de extinción.
  • Bioseguridad a través de la detección de especies indicadoras y/o invasoras.
  • Prevención de enfermedades, a través de la identificación de patógenos, parásitos, virus, entre otros.
  • Autentificación de agentes de control biológico.
  • Monitoreo de inoculantes bacterianos.
  • Verificación de materias primas en alimentos de uso directo o conservado.

Ventajas

  • Herramienta más precisa y rápida que los métodos tradicionales de identificación.
  • Las especies pueden ser detectadas incluso en bajas densidades.
  • La identificación es realizada en cualquier fase del ciclo de vida (huevo, larva, adulto o estado intermedio).
  • La técnica es NO-invasiva, ya que no requiere observar, colectar, ni sacrificar organismos.

Enfoque multiespecífico: basado en métodos que utilizan partidores universales o alguna modificación de ellos, que amplifican el material genético de un grupo de especies objetivo (metabarcoding), los cuales son secuenciados usando plataformas de secuenciación de próxima generación (NGS). A partir de esta información, las secuencias resultantes son comparadas con bases de datos de referencia para generar una lista de especies presentes en las muestras colectadas.

Aplicaciones

  • Monitoreos de biodiversidad en sistemas marinos, acuáticos y terrestres.
  • Evaluación de calidad ecológica de ecosistemas acuáticos.
  • Caracterización microbiana de diferentes matrices ambientales (e.g., suelo, agua residual, plantas, viñedos).

Ventajas

  • Enfoque muy poderoso, que permite la detección de múltiples especies pertenecientes a uno o a diferentes grupos taxonómicos sin tener previo conocimiento de los grupos y especies detectadas.
  • No se requiere experiencia en la identificación de especies.
Abrir chat
¿Tienes Dudas?
Hola, ¿Cómo podemos ayudarte?