¿Qué es el ADN ambiental?

Existen dos enfoques con los cuales podemos analizar el ADN ambiental: a través de la identificación de organismos de sólo una especie (enfoque uniespecífico o barcoding), y a través de la detección de organismos de muchas especies (enfoque multiespecífico o metabarcoding). El uso de uno u otro enfoque depende de los requerimientos de cada cliente.

Identificación uniespecífica usando ADN ambiental

Basada en técnicas que utilizan marcadores moleculares específicos por especie (barcoding), lo que permite identificar de forma específica a un organismo desde una muestra agua, sedimento, suelo, nieve, aire, o materia prima obtenida desde cualquier ambiente.

Aplicaciones:

  • Gestión y protección de especies nativas y/o endémicas, amenazadas o en peligro de extinción.
  • Bioseguridad a través de la detección de especies indicadoras y/o invasoras.
  • Prevención de enfermedades, a través de la identificación de patógenos, parásitos, virus, entre otros.
  • Autentificación de agentes de control biológico.
  • Monitoreo de inoculantes bacterianos en suelos.
  • Verificación de materias primas en alimentos de uso directo.

Ventajas:

  • Herramienta más precisa y rápida que los métodos tradicionales de identificación.
  • Se pueden detectar especies en bajas densidades.
  • Se pueden identificar especies en cualquier fase de su vida (larvas a adultos).
  • No invasivo, ya que no requiere sacrificio de organismos.

Identificación multiespecífica usando ADN ambiental

Basada en métodos que utilizan partidores universales que amplifican el material genético de un grupo de especies objetivo (metabarcoding). Después de la amplificación, los fragmentos de ADN son secuenciados utilizando plataformas de secuenciación de próxima generación. Las secuencias resultantes son comparadas con bases de datos de referencia para generar una lista de especies presentes en muestras colectadas.

Aplicaciones:

  • Monitoreo de biodiversidad en sistemas marinos, acuáticos y terrestres.
  • Evaluación de calidad ecológica de ecosistemas acuáticos.
  • Caracterización del microbioma del suelo, plantas, viñedos, entre otros.

Ventajas:

  • Enfoque muy poderoso, que permite la detección de muchas especies diferentes asociadas a uno o
    múltiples grupos taxonómicos sin tener previo conocimiento de las especies presentes.
  • No se requiere experiencia en la identificación de especies de ningún grupo.
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